As I think that is easier delete than write, I did a script to start scripts with the while loop for getopts already written. Then, if I don’t need to use arguments I just have to delete the block. I called it mkscript.sh and I saved it in my /bin folder. The way to use…
bash – Arguments de script
Parfois vous devrez peut-être utiliser le même script pour exécuter de nombreux scénarios différents comme par exemple différents modèles avec différentes données ou quelque chose de similaire. Si le code comporte de nombreuses variables, la modification directe du code peut être dangereuse ou au moins ennuyeuse . Par conséquent, il peut être préférable de donner…
bash – Script arguments
At some point in your work you may have to use the same script to run many different scenarios. Maybe different models with different data sets or something similar. If the code has many variables, directly modifying the code could be dangerous or at least boring. Therefore, it may be better to give the script…
awk – Filtrer un fichier à partir d’un autre fichier
C’était l’une des premières choses que j’ai apprises sur awk. Tout a commencé quand j’ai dû gérer un fichier de 700k SNP. Dans une étape du processus, j’ai du filtrer ce fichier en me basant sur une liste d’identifications. Je me souviens que j’ai essayé de le faire avec R et il n’a pas fonctionné…
awk – Filtering a file from another file
This was one of the first tips that I learned about awk. All started when I had to manage a 700k SNP file. In one step of the process I had to filter this file based on a list of individuals. I remember that I tried to do it with R but it did not…